|
||
|
||
Idéhäfte 6, Efter Linné
Idéhäfte 6 — Efter Linné (pdf-format)
Idéhäftet Efter Linné innehåller kortfattade hänvisningar till laborationer och övningar. De avsnitt i häftet som är kopplade till laborationer och övningar finns att hämta nedan. I anslutning till dessa avsnitt finns fullständiga beskrivningar till övningar och laborationer.
Upptäckternas tid är just nu!, s 2–3
Evolution i molekylärbiologiskt perspektiv, s 8–12
Consortium for the Barcode of Life www.barcoding.si.edu
The Barcode of Life Data Systems www.barcodinglife.org
Släktträd och bioinformatik, s 13–15
Banan och tomat - hur är de släkt?
I övningen beskrivs arbetsgången från extraktion, PCR och sekvensering av DNA till konstruktion av ett släktträd. Olika slag av växtmaterial används. Fullständig beskrivning av den metod för DNA-extraktion som beskrivs i laborationen finns i Bioscience explained vol 3, nr 2. Orginaltexten finns i häftet Investigation plant evolution, National Centre for Biotechnology Education, University of Reading, UK, www.ncbe.reading.ac.uk.
DNA-sekvenser från olika växtarter (word)
Skräp-DNA?
I denna övning studeras kodande och icke-kodande sekvenser i en gen.
Vilka är vi närmast släkt med? Manuell jämförelse mellan aminosyrasekvenser från några olika organismer. Övningen kan fungera självständigt, men även som en introduktion inför arbete med molekylärbiologiska databaser.
I övningen Släktträd med bioinformatik används plattformen Biology Student Workbench som ger tillgång till proteindatabaser och dataprogram för att kunna bygga släktträd.
En bioinformatisk genjakt I (Människans genom)
Sjukdomsframkallande gener från olika organismer studeras. Strukturen för det protein som bildas från genen studeras.
En bioinformatisk genjakt II
En jämförelse mellan olika arters genom. I övningen jämförs likheter och skillnader mellan kromosomer hos människa och andra arter genom att hämta information från databaser på nätet.
DNA från växter
En ambitiös labb där man extraherar DNA från växter och använder PCR för att ta fram en kloroplastgen som man i sin tur skickar för sekvensering. Sekvensen analyserar man sedan med hjälp av databaser på nätet.
Övningar på Forskning.nu
På denna webbsida ligger ett flertal bioinformatikövningar, samt teoretiska avsnitt med koppling till bioteknik.
Tyvärr har dessa övningar tagits bort från Forskning.se.
Pussla med DNA
Övningen, i form av ett pussel, visar hur en sammanhängande DNA-sekvens byggs, hur ett komplementärt mRNA bildas och hur tRNA medverkar för att bygga en aminosyrasekvens.
Ett färdigt pussel, alternativt en beskrivning, kan köpas från Netherlands Institute of Ecology. Det går också utmärkt att bygga ett eget pussel av trä eller papp. I det färdiga pusslet finns en koppling till forskningsresultat om bakterien Collimonas. Andra liknande kopplingar till kända gener i en organism kan göras genom att själv söka information i databaser.
Leveau, J. Fun with genomes: the Mycomuncher DNA puzzle. Nr 5 2007 s 28-31
Släta och skrynkliga ärtor - vilka är orsakerna? (Från Mendel till genteknik)
Laborationen från Mendel till genteknik visar olika egenskaper hos släta och skrynkliga ärtor i relation till den genetiska bakgrunden. Laborationen visar kopplingen mellan Mendels klassiska genetik och modern genteknik. Transposoners betydelse illustreras.
Är ärtor levande?
En torr gul ärta - är den levande? Flera försök beskrivs i laborationen som kan användas för att ge svar på frågan. Flertalet försök är mycket enkla, men även mer avancerade försök beskrivs.
Tree of Life web project
Science in school, www.scienceinschool.org: Hodge, R. A new tree of life. Nr 2 2006 s 17-19
Bi-lagan nr 3, 2003, Brickan som resurs i undervisningen
Biogasreaktor i miniformat
Laborationen beskriver den teoretiska bakgrunden för bioreaktorer, samt det praktiska genomförandet för att kunna bygga en enkel modell av en biogasreaktor.
Säkerhet vid arbete med mikroorganismer
På webbsidan från Nationellt resurscentrum för biologi och bioteknik finns utförliga anvisningar för arbete med mikroorganismer
Bakterier som använder ljus
Laborationen beskriver hur en Winogradskykolonn tillverkas. Kolonnen, som är enkel att tillverka, kan användas för att diskutera fotosyntes hos bakterier, såväl som anaeroba och aeroba förhållanden i relation till omsättningen av svavel i sediment.
Överallt finns det bakterier!
Laborationen visar hur bakterier från miljön kan odlas upp och studeras. Detta är en av de enklaste och mest grundläggande mikrobiologilaborationerna.
Hitta enstaka bakterier (Renodling av bakterier)
Laborationen visar den grundläggande sterilteknik som krävs för att kunna kontrollera och renodla en bakteriekultur. Metoden används också i forskning som beskrivs på s 5 i häftet Efter Linné.
Odla cyanobakterier
För bakgrund till problemen med algblomning i Östersjön, se Havet 2007, www.havet.nu
Cyanobakterier har förmåga till kvävefixering. Pröva att odla i såväl komplett medium som kvävefritt medium. Cyanobakterier orsakar problem med algblomning i Östersjön. Forskare diskuterar vilken betydelse tillförsel av kväveföreningar respektive fosfat har för algblomning. Pröva att odla cyanobakterier i lösningar med olika fosfathalt.
Separera plastidfärgämmnen
I laborationen beskrivs hur plastidfärgämnen från några olika fotoautotrofer separeras med papperskromatografi, isoleras och identifieras.
Jämförelser görs för att se släktskap mellan olika grupper som cyanobakterier, alger, gröna växter.
1. Spektra för plastidfärgämnen
2. Separation av plastidfärgämnen. Labbrapport
Kompletterande material
För dem som vill komplettera med att ta del av diskussionen om evolution och kreationism kan följande material vara en ingång:
Douglas J.Futuyamas. Evolution. Kap 22: Evolutionsvetenskapen, kreationismen och samhället. 2005
Bioteknik i skolan
På webbsidan från Nationellt resurscentrum för biologi och bioteknik finns avdelningen "Bioteknik i skolan". Ta del av kompletterande laborationer, övningar och annat material på denna sida.